七七事变后，古都北京沦为殖民地。被奴役型的社会结构，严重摧残着民族文化的自主生存。
1939年3月，日伪政权华北临时政府决定，将北京政府设立的关岳庙改建为武成王庙，祭祀历代名将。关岳殿被改为武德堂，将精忠报国改为褒扬武德。日伪统治者在北京设坛立庙，宣扬日本军国主义的武士道精神，严重损害了中华民族的尊严与传统，遭到爱国宗教人士和广大民众的抵制。
抗日战争时期，北京城区免于炮火劫毁。城内许多寺庙仍香火持续。40年代初，正觉寺、通教寺等少数佛教寺庙被香客捐资重建。然而，郊区战火频繁，许多著名的寺庙毁于战火。庙宇遭焚，佛像被劫，僧侣流散，损失惨重。京城佛教三大名寺之一的云居寺，被日军的炮火炸毁，千年古刹成为一片废墟。
到40年代后半叶，政局动荡，民生凋敝，文坛萧条，传统宗教更趋衰败。除少数古刹名寺香火延绵外，大多断壁颓垣，荆棘丛生。
