金瓶掣签，又称为金瓶鉴别，是藏族认定藏传佛教最高等的大活佛转世灵童的方式，是清王朝乾隆五十七年（1792年）正式设立的制度。
早在康熙年间，由于西藏内部和准噶尔部相互间的权力之争，引发了一场风波。准噶尔部洗劫并占领了西藏，杀死拉藏汗。暂居塔尔寺的噶桑嘉措活佛号召西藏人民配合入藏清军，扫除准噶尔人，收复藏地。鉴于噶桑嘉措活佛得到西藏、青海人民的拥戴，清军在入藏作战的同时，护送噶桑嘉措活佛入藏登达赖喇嘛之座。
1720年6月，清军分两路向西藏挺进，占领拉萨后，在各寺庙抓获准噶尔喇嘛101人，把5名总管喇嘛斩首，其余尽行监禁。9月15日，清军平逆将军延信为噶桑嘉措活佛举行隆重的坐床大典，确立其作为西藏宗教领袖的地位。同时把藏汗所立的六世达赖伊喜嘉措送到北京安置。
西藏出现的这次大风波有两个根源：一是新教（也称黄教）、旧教（红教）之争；二是达赖喇嘛继承人之争造成的恶果。在平息这场风波后，雍正五年（1727年），清廷设置了驻藏大臣，西藏直接隶属中央。
乾隆十五年（1750年），西藏郡王珠尔墨特那木扎挑起叛乱，被清军平定之后，清王朝中央颁布了《西藏善后章程》，由中央驻藏大臣和达赖喇嘛共理藏务。乾隆五十七年（1792年），清军在驱逐侵入西藏的廓尔喀匪军后，于1793年颁布《钦定西藏章程》，从制度上对驻藏大臣的地位与职权作了明确规定。同时实行“金瓶掣签”制度，规定西藏达赖喇嘛和班禅圆寂后，将各地呈报的转世灵童的姓名、出生时辰等呈交驻藏大臣汇总，用满、汉、藏三种文字写在签牌上，放入金瓶内，在驻藏大臣监督下掣签认定，并经中央批准后，方举行坐床大典。
这就消除了往往因达赖、班禅转世灵童之争而发生内乱，并进一步提高了中央驻藏大臣的权威。驻藏大臣制度的建立，两个《章程》的颁行，“金瓶掣签”制度的实行，加强了中央在西藏的统辖，有利于西藏的稳定和繁荣发展。
