学术思想史专著。最早由黄宗羲整理。康熙十五年（1676），黄宗羲完成《明儒学案》后续修此书，仅成17卷并序而卒，其子黄百家续作，又成8卷，后由私淑弟子全祖望于乾隆十二年至二十年（1747年～1755年）补述，成91学案，也未竟而卒，底稿归勤县卢氏抱经堂，残本归宿愿蒋氏。
黄宗羲六世孙黄征、七世孙黄直垕又补充为86卷。道光年间，流入浙江学政陈少宗手。道光十八年（1838），王梓材、冯云濠受督学何凌汉委托，校勘补正，并遵照全祖望在序录中确定的分卷方案，将全稿正式定为100卷。
学案共记宋元学者超过2000人，于道光十八年（1838）刊于浙江，然而毁于鸦片战争。光绪五年（1879），张汝霖再次主导，翻刻于长沙，成通行的100卷学案。
《宋元学案》从草创到成书、刊行，前后历经两百余年。与《明儒学案》相比，该书更加注重人物之间的师承关系，并以此作为划分学派的重要依据。91学案中，每案先列一表，述及案主的师友、门人、亲属等关系；次为案主小传，论其生平、学术宗旨；再附学侣、家学、门人、同调、私淑、续传六项为附案，分别介绍有关人物的状况。
此外，书中还有许多编校者加增的案语，多为校勘说明及史实考证之类。后代学者认为，该书虽然是根据黄宗羲的思路和框架编撰而成，但黄本人完成的部分有限，他对宋元学术的认识、评论远没有被充分地展现出来。后续者的思想、识见，又显然不及黄深刻，因此该书中少了很多深入、精彩的观点和点睛之笔，其主要价值体现在对资料的搜集、整理和保存方面。《宋元学案》百卷本初刻于道光十八年（1838），后又有道光二十六年（1846）何绍基刻本和光绪五年（1879）龙汝霖刻本。1986年中华书局出版点校本。
