百里奚在秦国做的另一件大事是，他和蹇叔一道，阻止秦军偷袭郑国。秦穆公三十年（前634），秦军伐郑。秦军退回之后，为了便于监视郑国的活动，派大夫杞子等人驻守郑国。秦穆公三十二年(前632)，杞子派人向秦国报告说：“郑人让我掌握京城北门的锁匙，如果派军队来偷袭，内应外合，郑国就可得到了。”（《左传》僖公三十二年）穆公征询蹇叔、百里奚的意见，他们说：“经过好几个国家，一千多里路去偷袭人家，很少能成功的。而且有人出卖了郑国，又怎么知道我们国内没有人将我们的举动告诉郑国呢？这事是不可以做的！”穆公为利所诱，不听两人劝阻，派百里奚的儿子孟明视、蹇叔的儿子西乞术和白乙丙率军攻郑。出发的那天，百里奚、蹇叔两人大哭，惹得穆公很不高兴。二位老人退下后，私底下对他们的儿子说：“你们的军队一定会在肴地战败的。”穆公三十三年（前631）春，秦年向东边出发，去偷袭千里之远的郑国，途中得知郑国已有准备，三位将领觉得偷袭不可能了，就撤军回国，顺路灭掉了一个叫滑的小国。滑在晋国的边地，是晋的同姓国与盟国，当时晋文公刚死还没有埋葬，继位的太子襄公得知秦军灭滑，很生气地说：“秦国欺侮我父亲刚死，乘人之危攻取了滑！”于是披着丧服，派兵在地势险恶的肴地（山名）阻击秦军，大获全胜，秦军没有一人逃脱，三位将领也成了俘虏。秦晋本是盟国，不仅地理位置上接壤，而且世代联姻。秦穆公的夫人是晋献公的女儿，晋文公的夫人，也就是襄公的母亲是秦穆公的女儿，这就是后人所说的“秦晋之好”，这次却因为秦的无礼而爆发了战争。晋文公的夫人听说三位秦将成了俘虏，就替他们求情说：“（秦）穆公对这三人恨之入骨，希望你能让三人回去，使我君（指穆公）能亲自烹杀他们。”晋襄公见母亲求情，就答应了，送三将回秦。三将快到秦国国都时，穆公穿着丧服到郊外去迎接，向三人哭着说：“我因为不听百里奚、蹇叔的话，让你们受到侮辱，你们有什么罪过呢？你们用心准备湔雪这次耻辱吧，不要懈怠了。”不仅恢复三人的官职，还比从前更加厚待。三年后，穆公三十六年（前628），穆公再命孟明视等为将伐晋，“渡（黄）河焚船”，下了死战的决心，大败晋人，占领了王宫，报复了战败于毂的耻辱。正是因为有这样知人善任的国君，有五羖大夫”这样的贤能之臣，君臣齐心协力，秦才由蕞尔小国逐步发展壮大成大国，并最终在秦王政时翦灭诸国，统一中国，第一次把中国建立成统一的封建王朝——秦朝。
