春秋末叶、战国初年的社会大变动，至战国中后期，由于各国之间政治、军事斗争的加剧，社会变动更加激烈，这种历史环境为庄子继承并有所发展老子的辩证法思想，提供了客观的依据。
庄子对于自然、社会和人生中的矛盾有着深刻而细致的观察。他看到了矛盾的普遍存在，对于矛盾对立面的相互关系和对立统一规律有着一定的认识，这是其辩证法思想的表现；但是庄子的哲学中存在否认差别的诡辩论，其哲学的辩证法和诡辩论往往交织在一起，这是庄子哲学的一个重要特征。
《齐物论》是庄子哲学思想的代表作，这篇文章的宗旨在于论述万物齐一和是非相对，其中涉及了主体与客体关系的认识论问题。
辩证法是研究事物本身矛盾的学问。庄子对于他所研究的对象，普遍采取了揭露矛盾的方法，由此提出了“彼”与“是”的矛盾概念。“彼”即彼方、对方；“是”即此方、我方。庄子把“彼”与“是”的观念推而广之，用来泛指客观世界普遍存在的矛盾双方。他认为，矛盾双方是相互对立的，又是相互依存的。《齐物论》说：“物无非彼，物无非是。自彼则不见，自是则知之。”任何事物都处于矛盾对立之中，每个事物既是矛盾的此方，又是矛盾的彼方。彼与此既互相对立又共存于一体。只有看到两个方面，才能得到比较全面的认识。《齐物论》接着说：“彼出于是，是亦因彼，彼是方生之说也。”矛盾的彼方出于此方，矛盾的此方也依赖于彼方。矛盾双方相互依赖不可分离，所以双方是并生并存的。
庄子的矛盾双方彼是相因的观点是对矛盾同一性的明确表述。《齐物论》接着说：“方生方死，方死方生；方可方不可，方不可方可。”其大意是指万物都在变化，必将走向自己的反面。对于任何事物的肯定之中都必然地包含着否定的因素。所以说“方生方死，方死方生”肯定了生死的相互依存、相互渗透和相互转化。这些论述都包含着矛盾对立面相互关系的辩证法思想。
庄子不仅指出了矛盾双方的相互依存和转化，而且进一步指明了一切事物都是在互相对待的情况下，获得了各自的规定性。世界上没有孤立的存在物，一切事物都是在与各种事物的相互对峙中存在，都是在周围的环境中取得自己的规定性。对于事物运动变化的原因，庄子认为就在于事物自身。万物运动不息，而运动的动力在于事物自身，庄子称之为“自化”。你只要顺任自然无为就行，万物是自生自化的。
庄子辩证法的一个重要方面是从事物运动变化的绝对性及时间、空间的无限性出发，说明了人类认识的局限性和相对性。在这些论述中接触到绝对与相对、有限与无限的辩证关系。庄子说：“吾生也有涯，而知也无涯。”以有限的生命，如何能穷尽在无限的时间流逝中所发生的无穷无尽的宇宙的演化呢？庄子没有也不可能作出科学的解释。但是，提出这个矛盾本身就是非常深刻的。
