炎帝神农氏同时是我国的医药之神，传说他有一根神鞭，叫做“赭鞭”。这根神鞭一抽到草药上，就能分辨出药性。是温是寒，有毒还是无毒，一看就明白。然后他根据这些草药的各种不同药性，来为人们治病。
另一种传说说他亲自尝试各种草药，拿到嘴里嚼，一一辨别药性。他曾经在一天之内中过七十次毒。好在他不同于一般的凡人，可以自己解毒。
还有一种传说是，神农生下来就有一个水晶肚子，光亮透明，从外面可以清楚看见他的五脏六腑。有一年人间瘟疫流行，死了很多人。神农看了非常伤心，于是他下定决心，要找到治病的药，解除人们所受疾病的煎熬和痛苦。他孤身一人跑到深山老林里去，采来草药，在自己身上做试验。他每吃一种草，就低头看草在自己肚子里消化的情况，并且把品味出来的药性，一一记在心里。他随身还带着两个袋子。好吃的有用的草，他就放在左边的袋子里；不好的就放在右边的袋子里，这样就不至于弄混淆了。
开始的时候，他尝了一种尖尖的、嫩嫩的小绿叶儿。刚吃下去，可奇怪了：只见它在肚子里从上面擦洗到下面，又从下面擦洗到上面，把肚子里的各个部位都擦洗得清爽又舒服。神农看它像在上卜下下地巡查一样，就叫它“查”，后来人们叫错了，说成了“茶”，神农把茶放进了左边的袋子里。
接着，他尝了一种野花。刚吃下去就感到肚子剧痛无比，神农低头一看，那野花在肚子里变成了几寸长的虫子，一动一动地在咬他的肠胃。神农吃了许多草药都没有用。当他吞下茶时，发现茶一触到虫子，虫子就化了。神农知道茶还有解毒的功效，高兴极了。神农便把这种野花放在右边的袋子里。
后来，神农把他尝过的草，根据药性编成了一本医书，传给了百姓，这本书就是《神农本草》。
到了最后，神农见到一朵黄黄的小花。那叶子还在一张一缩的动呢。怪啊，不会是妖草吧？神农才把叶子放进嘴里，肚肠就一节一节地断开了，他来不及吃茶叶，就这样死啦！人们把这种草叫做“断肠草”。
人们看到神农为了拯救人类而牺牲了自己，非常敬重他，称他为“药王菩萨”。现在好多地方都盖有“药王庙”，来供人们跪拜祭祀他呢。
