隋唐时期政府设有专门的医学机构尚药局和太医署。尚药局负责宫廷的医药事宜，太医署主管全国的医学教育。当时已分科治疗，分为体疗、疮肿、少儿、耳目口齿、针科、按摩科。名医辈出，有许多医学著作问世。
隋时的名医有许智藏、许澄均等，巢元方最为著名。巢元方撰有《诸病源候论》50卷，于610年成书，是我国第一部详论疾病分类和病因、病理的著作。
唐时的名医有许胤宗、张文仲、李虔纵、韦慈藏、孟诜等，而最杰出的是唐初的孙思邈。
孙思邈(581—682年)京兆华原(耀县)人。他放弃高官，一生在民间采药行医。他特别注重医德、医术，关心病人。孙思邈在高宗时写成《备急千金要方》30卷，30年后在此书基础上写成《干金翼方》30卷，合称《千金方》。《千金方》收载800多种药物和5300多处方，总结了唐代以前的医学理论和治疗经验。孙思邈对妇科、儿科特别重视，主张分没妇、儿科。他首创复方，提出一方治多病，多方治一病的方法，重视特效药物的研究，对于治疗瘿病、脚气病的方法在当时是十分先进的。这两部书是孙思邈对祖国医学的最大贡献。后世尊他为“药王”，他采药的华原(耀县)五台山被称为药王山，山上有孙思邈纪念馆，有许多与孙思邈有关的碑石。人们永远怀念这位伟大的医学家。
此外，还有几部重要的医学著作。苏敬奉高宗之命编写的《唐新本草》，这是一部图文并茂的药物学专著，全书共53卷，收集药物844种，是世界上第一部由国家颁定的药典。王焘编的综合性医学专著《外台秘要》、蔺道人的烧伤专著《仙授理伤续断秘方》、昝殷的妇产科专著《经效产宝》等对后代医学影响很大。
