药王是谁？其实是有很多种说法的。简单来讲，药王是古代对精通医术的名医和传说人物的景仰，后演化为道教供奉的主司医药之神。
道教供奉的药王神灵众多。主要有：一，传说神农尝百草，首创医药，世尊为药王；二，黄帝太医扁鹊，洞晓医源，道教尊其为灵应药王真君；三，唐代道士、著名医学家孙思邈，著有《千金方》、《千金翼方》传世，人们尊其故里五台山为药王山；四，唐代名医韦慈藏，深明医理，名扬天下。
明清两代，京城药王庙著名的有四座，均为历代名医的群祀庙。其中位于崇文门外东晓市大街的南药王庙，始建于明末天启年间，殿宇宏伟，规模最大。
这座庙是以祭祀药王为主的道教寺庙。该庙的主要建筑，分为东、匿两部分。西部是传统的寺庙形式，共有三层大殿。
第一层为药王殿。正殿中央供奉伏羲、神农、黄帝塑像，其左下方供药王孙思邈、右下方供药王韦慈藏。大殿两侧分别站立十大名医，即：三皇时的岐伯、雷公，战国时的扁鹊，汉代的淳于意、张仲景，三国时的华陀，晋代的王叔和、皇甫谧、葛洪，唐代的李景和。历代名医塑像，道装儒服不一。东配殿供马王爷和龙王爷。传说马王爷三只眼，主管天下飞禽走兽，龙王爷主管风调雨顺。西配殿供月下老人，传说他能牵引红线，巧配姻缘。
第二层为玉皇殿。正殿供奉玉皇大帝，东站四大天王，西列兵器。东配殿供斗姆娘娘。相传她是北斗众星之母，礼拜斗姆可以解除苦难。西配殿供奉九位圣母：天仙圣母、眼光圣母、子孙圣母、痘疹圣母、斑疹圣母、送生圣母、催生圣母、乳母圣母、引蒙圣母。分别主管各种与妇女生育相关的事宜。
第三层为三清殿。正中供奉玉清元始天尊、上清灵宝天尊、太清太上老君。两侧分别供奉着道教的十几位神灵。三清殿正西有一座二层小楼。楼下是关公殿，楼上为喜神唐明皇。每年四月二十八日，京城许多戏曲艺人来此焚香祭祀其行业祖师喜神。
药王庙的东部建筑也贯穿在南北一条轴线上。第一层为吕祖殿。供奉道教八仙中的吕洞宾。其后有文昌殿、真武殿。相传文昌是北斗七星之上六颗星的总称，是主宰人间功名禄位之神。京城文人墨客常来文昌殿焚香请愿，以求仕途坦荡。真武为传说的玄武，在北方。它与青龙、白虎、朱雀合称四方之神，威镇环宇，保佑四方吉庆太平。真武殿后有一座戏楼。城南一带的士商、梨园、行会等祭祖时，常来此处办堂会。戏楼北是药王寝宫。宫内供奉着药王和十大名医。寝宫西边的配殿供奉财神爷赵公明。最后有一座二层楼。楼上供奉着东王公、太阳公、东岳大帝、灶王爷、道教南北五祖等几十位神像。
